Le nom de famille Michellier est extrêmement rare et son origine précise n'est pas directement documentée dans les dictionnaires étymologiques classiques pour cette forme spécifique. Cependant, il est très probable qu'il soit un dérivé ou une variante orthographique d'un nom plus courant.

L'hypothèse la plus solide le relie au prénom Michel et à ses dérivés.

• Le prénom Michel est d'origine hébraïque (Mikha'el), signifiant « Qui est comme Dieu ? ». C'est un prénom biblique très répandu en Europe depuis le Moyen Âge, notamment en raison du culte de l'Archange Michel.
• Le suffixe -ier (ou -llier dans ce cas, la double consonne pouvant être une variante phonétique ou régionale) est courant en français et peut indiquer :
  • Un lien de filiation, désignant "le fils de Michel" ou "celui qui est de la famille de Michel" (sens patronymique).
  • Une profession ou un métier. Par exemple, le nom "Michelier" (une forme plus courante et étymologiquement liée) peut désigner un boulanger ou un vendeur de miches (un type de pain rond).
  • Une provenance géographique, faisant référence à une personne originaire d'un lieu-dit "Le Michelier" ou "La Michellière", ou un lieu caractérisé par la présence d'une famille nommée Michel.

Compte tenu de sa rareté, Michellier pourrait être une forme ancienne ou une altération orthographique régionale de "Michelier", un patronyme tiré du prénom Michel, ou un nom lié à une activité économique ou un lieu associé à ce prénom.