L'étymologie du nom de famille Hugueny suggère une origine patronymique, dérivant du prénom ancien Hugues.

Le prénom Hugues est la forme française du prénom germanique Hugo, signifiant « esprit », « intelligence » ou « cœur ». Il était très populaire au Moyen Âge, donnant naissance à de nombreux patronymes et diminutifs.

Le suffixe -eny est une variation de diminutifs courants tels que -et ou -ot que l'on retrouve dans des noms comme Huguenet ou Huguenot. Ces diminutifs étaient souvent utilisés pour désigner le « petit Hugues » ou le « fils de Hugues », indiquant ainsi une filiation ou une appartenance à une famille.

Il est également important de noter la forte résonance avec le terme Huguenot, désignant les Protestants français. Bien que l'origine précise du terme Huguenot soit débattue (certaines théories le liant à des figures comme Hugues Capet ou à des mots allemands), la similarité phonétique entre Hugueny et Huguenot a souvent conduit à des associations. Il est possible que le nom Hugueny ait pu, dans certains contextes et régions, indiquer une ascendance ou une affiliation, ou simplement être une variante locale d'un nom déjà dérivé de Hugues, ayant pris une signification supplémentaire au fil du temps en raison de cette proximité phonétique.

En somme, Hugueny est très probablement un dérivé du prénom Hugues, indiquant une filiation ou une appartenance à une famille portant ce prénom, avec une possible influence ou résonance historique liée au mouvement protestant en France.