Le nom de famille Issot est relativement rare et son origine est principalement attestée dans le nord de la France, particulièrement dans la région du Pas-de-Calais.

Comme pour de nombreux noms anciens et peu répandus, son étymologie exacte peut être sujette à plusieurs interprétations, mais les hypothèses les plus plausibles s'orientent vers :

• Un diminutif de prénom : C'est l'explication la plus courante pour les noms se terminant par le suffixe -ot, très fréquent en ancien français et utilisé pour former des diminutifs. Issot pourrait ainsi être un hypocoristique (forme familière) ou un diminutif d'un prénom commençant par "Is-", comme Isidore. Le prénom Isidore, d'origine grecque (signifiant "don d'Isis"), a été largement répandu et honoré par plusieurs saints. "Isso" aurait pu être un diminutif de ce prénom, auquel le suffixe -ot aurait été ajouté pour désigner "le petit Isso" ou "le fils d'Isso".
• Une origine toponymique : Moins probable sans références spécifiques, mais la racine "Iss-" pourrait dériver d'un ancien lieu-dit ou d'une petite localité. Par exemple, "is" ou "isse" peut parfois être lié à une "île" ou un "islet" (petite île, banc de sable), ou à une caractéristique géographique. Le suffixe -ot indiquerait alors une petite propriété ou un habitant originaire de ce petit lieu.
• Un surnom : Bien que moins étayée pour ce nom précis, il pourrait s'agir d'un surnom lié à une caractéristique physique ou morale du premier porteur, qui aurait ensuite été transformé en diminutif. Cependant, sans un sens évident pour la racine "Iss-", cette piste est plus spéculative.

En l'absence de registres ou de documents spécifiques détaillant l'origine du nom pour les premiers porteurs, l'hypothèse du diminutif d'un prénom (potentiellement Isidore) est généralement la plus retenue par les onomasticiens pour des formations similaires.