D'origine grecque, le nom de famille Goudouly semble dériver du mot grec ancien « γούδουλας » (goudoúlas).

Ce terme désignait à l'origine une grande bassine, une auge ou une écuelle en bois. L'attribution de ce nom comme patronyme pourrait avoir plusieurs origines possibles :

• Un nom de métier : Il aurait pu être donné à une personne qui fabriquait, vendait ou utilisait de tels récipients (par exemple, un tonnelier ou un artisan du bois spécialisé dans ces objets).
• Un surnom descriptif : Il aurait pu désigner une personne de corpulence robuste, de forte stature, ou dont la démarche évoquait une certaine lourdeur ou rusticité, par analogie avec la forme ou la fonction d'une "auge" ou d'une "bassine".
• Une origine toponymique : Bien que moins fréquente, il est parfois possible que le nom provienne d'un lieu-dit, d'une caractéristique géographique ou d'une localité liée à la présence ou à la fabrication de ces objets.

Comme de nombreux noms de famille grecs, Goudouly est probablement un ancien surnom ou un nom de profession transformé en patronyme héréditaire, souvent lié à des caractéristiques physiques, des métiers ou des traits de personnalité observés dans un environnement rural ou artisanal.